Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pkn3Q8K045 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pkn3Q8K045 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pkn3Q8K045 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pkn3Q8K045 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkn3Q8K045 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkn3Q8K045 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkn3Q8K045 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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