Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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