Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Fbxo48Q8CAT8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Fbxo48Q8CAT8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fbxo48Q8CAT8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fbxo48Q8CAT8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fbxo48Q8CAT8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms