Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg4aQ8C9S8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4aQ8C9S8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms