Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp44Q8C2S0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp44Q8C2S0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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