Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Znf428Q8C1M2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf428Q8C1M2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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