Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbbp5Q8BX09 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp5Q8BX09 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp5Q8BX09 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp5Q8BX09 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbbp5Q8BX09 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbbp5Q8BX09 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbbp5Q8BX09 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbbp5Q8BX09 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbbp5Q8BX09 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbbp5Q8BX09 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbbp5Q8BX09 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbbp5Q8BX09 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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