Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx17Q8BVL3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx17Q8BVL3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx17Q8BVL3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx17Q8BVL3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx17Q8BVL3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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