Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms