Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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