Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd1cQ76I25 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms