Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Zbtb40Q6PCS8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zbtb40Q6PCS8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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