Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms