Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NipblQ6KCD5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms