Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CltbQ6IRU5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms