Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms