Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Surf4Q64310 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms