Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms