Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Trappc1Q5NCF2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms