Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trim58Q5NCC9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim58Q5NCC9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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