Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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