Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms