Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm28274-202ENSMUST00000187775 1157 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm28202-203ENSMUST00000189780 1157 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf166Q3U9F6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf166Q3U9F6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms