Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms