Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp39Q3TIX9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp39Q3TIX9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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