Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms