Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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