Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rpusd3Q14AI6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rpusd3Q14AI6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rpusd3Q14AI6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rpusd3Q14AI6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rpusd3Q14AI6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rpusd3Q14AI6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rpusd3Q14AI6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms