Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab42Q0PD08 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms