Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps3aP97351 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms