Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sumo1P63166 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms