Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl23P62830 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl23P62830 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms