Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms