Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms