Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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PctpP53808 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PctpP53808 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PctpP53808 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PctpP53808 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms