Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms