Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rpl28P41105 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms