Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VhlP40338 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms