Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms