Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms