Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tsta3P23591 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms