Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms