Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms