Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms