Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms