Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms