Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ifnb1P01575 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ifnb1P01575 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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