Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms