Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Prrt1O35449 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Prrt1O35449 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Prrt1O35449 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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