Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms